Во-первых, стоит проверить сортовая ли у вас была посажена кукуруза, если на пакетике с семенами была английская F1, то это гибрид первого поколения, а не сорт и оставлять семена с таких растений нет смысла. Как бы ни вкусны были початки нынче, на будущий год результат может оказаться совсем не таким, а может его вообще не быть. Если же это сорт, то початок с хорошо созревшими семенами достаточно положить в сухое, проветриваемое место, недоступное для грызунов. Когда полностью высохнет, можно вылущить из него зерна, а можно и так оставить. Если нет сырости в месте хранения, то зерна одинаково хорошо хранятся и так и так.